شعبه نهم دادگاه کیفری یک استان تهران روز ۲۸ اسفند ۱۳۹۶، حکم اعدام محمد ثلاث را تایید کرده و پرونده وی را کامل ترین پرونده خوانده است. (خبرگزاری میزان – ۲۸ اسفند ۱۳۹۶)
قوه قضاییه ایران اعلام کرده که این حکم را یک روز پس از آخرین دادگاه رسیدگی به اتهامات ثلاث صادر و به صورت ویژه به وکیل او ابلاغ کرده است.
محمد اشرفزاده وکیل تسخیری محمد ثلاث گفته است که هنوز حکمی به او ابلاغ نشده است.
وکیل تسخیری این درویش گنابادی روز ۲۷ اسفند در آخرین جلسه دادگاه گفته بود که در هنگام حوادث رانندگی، «راننده قاتل محسوب نمیشود».
محمد ثلاث یکشنبه ۲۷ اسفند در آخرین جلسه دادگاه رسیدگی به اتهامش گفته بود: اتهام قتل عمد سه مامور پلیس را نمیپذیرد.
وی گفت که راننده اتوبوس بوده اما به عمد به سمت ماموران پلیس حرکت نکرده است.
محمد ثلاث در جلسه اول دادگاه نیز گفته بود: «پیش از نزدیک شدن به ماموران یگان ویژه چند بار چراغ و بوق زده اما ماموران کنار نرفتهاند».
رئیس پلیس تهران روز چهارشنبه ۹بهمن ۱۳۹۶، در مصاحبه با خبرگزاری فارس گفت که امیدوار است با هماهنگی با دستگاه قضایی عامل “حمله اتوبوس” به مأموران امنیتی در تجمع دراویش، تا پایان سال به دار آویخته شود.
منابع خبری حکومتی نام راننده اتوبوس را یاور محمد ثلاث اعلام کردند و مصاحبهای تلویزیونی از او در صدا و سیمای ایران پخش شد که روی تخت بیمارستان و با سر و صورت زخمی، مسئولیت حمله را بر عهده گرفته بود.
لازم به ذکر است که برخی از دراویش گنابادی حاضر در محل درگیریها، با انکار نقش محمد ثلاث در رانندگی اتوبوس، گفته بودند که او پیش از حمله اتوبوس به نیروهای انتظامی بازداشت شده بود.