صبح روز ۳۱ تیر ۱۳۹۷، ماموران امنیتی به منزل کشیش یوسف ندرخانی مراجعه کرده و پس از ضرب و شتم ایشان و فرزندشان، وی را بازداشت و به شعبه دو اجرای احکام دادگاه انقلاب رشت منتقل کردند.
این یورش در حالی صورت گرفت که پیشتر هیچ گونه احضاریه جهت اجرای حکم حبس این کشیش به دست وی نرسیده بود.
بنا به گفته یکی از بستگان یوسف ندرخانی «صبح روز یکشنبه ماموران لباس شخصی به منزل یوسف رفته و با ضربات پا به درب منزل سعی می کنند را بشکنند و وارد منزل ایشان شوند، پس از اینکه پسر آقای ندرخانی درب را باز میکنند با استفاده از شوکر الکتریکی پسر آقای ندرخانی را به زمین میزنند و بعد از ورود به خانه در حضور همسر و فرزند دیگر آقای ندرخانی ایشان را با استفاده از شوکر و به همراه ضرب و شتم به زمین میزنند و نهایتا با خود میبرند.»
بنا به گفته این مبنع «پس از پیگیری خانواده آقای ندرخانی به ایشان گفتهاند که قرار است امشب آقای ندرخانی را به زندان اوین تهران منتقل کنند.»
لازم به توضیح است که یوسف ندرخانی از ۱۹ سالگی به مسیحیت گروید، در سال ۸۸ به جرم ارتداد به اعدام محکوم شد. از او خواسته شده بود از تغییر دین توبه کند که او مخالفت کرد. او مدتی در زندان بود تا در نهایت در سال ۹۱ از زندان آزاد شد. آن زمان اعلام شد که وی به سه سال محکوم شده که چون این مدت را در زندان گذرانده، آزاد می شود.
اما مجدد در دادگاه تجدید نظر وی به اتهام پیروی از مسیحیت و اقدام علیه امنیت کشور همراه با سه تن از شهروندان مسیحی دیگر به ۱۰ سال حبس محکوم شده است.