زندانی سیاسی شکیلا منفرد محبوس در زندان قرچک ورامین روز دوشنبه ۱۷ خرداد ۱۴۰۰ در پی عدم رعایت اصل تفکیک جرائم توسط تعدادی از زندانیان با جرائم عمومی اجیر شده توسط مسئولان زندان، مورد ضرب و شتم قرار گرفت و مجروح شد.
زندانیان اجیر شده توسط ماموران زندان ضمن فحاشی و توهین به شکیلا منفرد، وی را با درب قوطی تن ماهی مجروح کردند.
وی روز یکشنبه ۱۲ اردیبهشت ۱۴۰۰ از زندان اوین به زندان قرچک ورامین منتقل شده بود.
وی در حال گذراندن دوران محکومیت ۴ سال و دو ماه حبس خود در زندان است.
شکیلا منفرد روز ۱۰ شهریور ۱۳۹۹ در هنگام خروج از منزل خود توسط نیروهای امنیتی در تهران بدون ارائه حکم قضایی، بازداشت و به یکی از بازداشتگاه های سازمان اطلاعات سپاه در تهران منتقل شد.
وی در روز ۱۹ شهریور ۱۳۹۹ با پایان مراحل بازجویی به قرنطینه بند زنان زندان اوین منتقل و در روز ۲۴ شهریور با تودیع قرار وثیقه ۴۰۰ میلیون تومانی به طور موقت و تا پایان مراحل دادرسی از زندان اوین آزاد شد.
جلسه دادگاه شکیلا منفرد، آرشام رضایی و محمد ابوالحسنی از بابت پرونده مشترک در روز اول بهمن سال ۱۳۹۹ در شعبه ۲۶ دادگاه انقلاب تهران برگزار شد.
در این جلسه دادگاه وی به اتهام فعالیت تبلیغی علیه نظام و توهین به مقدسات اسلام به ۶ سال حبس تعزیری و ۴ ماه کار اجباری در جهاد کشاورزی محکوم شد؛ پس از پایان این جلسه دادگاه، وی توسط ماموران اطلاعات سپاه به زندان منتقل شد.
شکیلا منفرد در نهایت در شعبه ۳۶ دادگاه تجدیدنظر استان تهران به ۴ سال و ۲ ماه حبس تعزیری محکوم شد.